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T/CQSES 27-2025 基于环境DNA的长江水生生物监测与完整性评价技术导则

名称：T/CQSES 27-2025 基于环境DNA的长江水生生物监测与完整性评价技术导则 - 下载地址2
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资料介绍

　　团体标准

　　T/CQSES 27—2025

　　2025‑07‑08 发布2025‑10‑08 实施

　　基于环境DNA 的长江水生生物监测

　　与完整性评价技术导则

　　Technical guideline for environmental DNA-based biomonitoring and

　　biological integrity evaluation for aquatic organisms in the Yangtze River

　　重庆市环境科学学会

　　前言……………………………………………………………………………………………………………Ⅲ

　　1 范围…………………………………………………………………………………………………………1

　　2 规范性引用文件……………………………………………………………………………………………1

　　3 术语和定义…………………………………………………………………………………………………1

　　4 技术流程……………………………………………………………………………………………………2

　　5 基于环境DNA 的长江水生生物监测………………………………………………………………………2

　　6 长江水生生物完整性评价…………………………………………………………………………………7

　　附录A(资料性) 长江水生态考核试点水体名单及重点保护水生生物期望值…………………………11

　　附录B(资料性) 长江流域水生生物监测位点清单………………………………………………………13

　　附录C(资料性) 中华鲟和长江江豚条形码基因扩增引物………………………………………………23

　　参考文献………………………………………………………………………………………………………24

　　T/CQSES 27—2025

　　前言

　　本文件按照GB/T 1. 1—2020《标准化工作导则第1 部分：标准化文件的结构和起草规则》的规定

　　起草。

　　请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。

　　本文件由中国环境科学研究院提出并归口。

　　本文件起草单位：中国环境科学研究院、天津市滨海新区环境创新研究院、白洋淀流域生态环境保障

　　中心、雄安新区生态环境监控中心、天津松山环保科技有限公司、广东工业大学、上海海洋大学。

　　本文件主要起草人：闫振广、乔桥、凌佳楠、王书平、周静博、张依章、殷竹君、吕梦宇、朱天哲、许晓静、

　　孙福红、张远、李晨虹、范俊韬、郑欣、门姝慧、王鹏远。

　　Ⅲ

　　T/CQSES 27—2025

　　基于环境DNA 的长江水生生物监测与完整性评价技术导则

　　1 范围

　　本文件规定了基于环境DNA 技术对长江水生生物进行监测和完整性评价的技术要求。

　　本文件适用于在长江流域范围内，对包括鱼类、大型底栖无脊椎动物、浮游动物及重点保护水生生物

　　在内的水生生物进行监测与生物完整性的评价，其他流域参照使用。

　　2 规范性引用文件

　　下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中，注日期的引用文

　　件，仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件，其最新版本(包括所有的修改单)适用于本

　　文件。

　　GB/T 30989 高通量基因测序技术规程

　　GB/T 35537 高通量基因测序结果评价要求

　　GB/T 40226 环境微生物宏基因组检测高通量测序法

　　HJ 91. 2 地表水环境质量监测技术规范

　　HJ 1296 水生态监测技术指南湖泊和水库水生生物监测与评价(试行)

　　SL/T 793 河湖健康评估技术导则

　　SN/T 4278 国境口岸医学媒介昆虫DNA 条形码鉴定操作规程

　　3 术语和定义

　　下列术语和定义适用于本标准。

　　3. 1

　　生物完整性biological integrity

　　生态系统具备支持和维护区域内平衡的、完整的、自适应的生物群落的能力，生物群落具有与自然生

　　境状态相适应的物种组成、多样性和功能组织。

　　[来源：HJ 1295—2023，3. 6，有修改]

　　3. 2

　　环境DNA environmental DNA

　　环境介质中发现的源自许多不同生物的DNA 复杂混合物，其中DNA 的来源包括完整细胞、游离

　　DNA 甚至完整的生物体。

　　3. 3

　　DNA 条形码DNA barcode

　　一种利用生物体细胞核或细胞器中特定的、标准的短DNA 序列来快速鉴别和分类物种的分子工具，

　　该序列具备种间变异性和种内保守性。

　　3. 4

　　索引index

　　通过PCR 或文库准备过程中为每个样品添加一个短序列的核苷酸碱基对，允许多个样品在一个高

　　T/CQSES 27—2025

　　通量测序运行中被汇集。这个序列对于运行中的每个样本都是不同的，并使序列能够在测序后分配回它

　　们来自的样本。

　　[来源：T/CSES 81—2023，3. 10]

　　3. 5

　　操作分类单元operational taxonomic unit;OTU

　　将测序得到的海量序列根据相似性聚类策略分组，获得的在分子水平上表征物种的单元。

　　[来源：DB11_T 2358—2024，3. 8，有修改]

　　4 技术流程

　　基于环境DNA 对长江水生生物进行监测与完整性评价的技术流程见图1。该技术流程主要包含水

　　生生物监测和水生生物完整性评价两部分。首先通过在长江流域合理布设监测点位进行环境DNA 采

　　样、环境DNA 提取、基因扩增、测序和生物信息学分析等步骤，经过质量控制和质量保证后，对长江流域

　　水生生物进行完整性评价。

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　　图1 基于环境DNA 的长江水生生物监测与完整性评价技术流程

　　5 基于环境DNA 的长江水生生物监测

　　5. 1 环境DNA 采样

　　5. 1. 1 目标生物类群及采样介质

　　监测目标生物类群包括：鱼类、大型底栖无脊椎动物、浮游动物和重点保护水生生物等，其常见采样

　　介质及适用水体类型见表1。

　　T/CQSES 27—2025

　　表1 监测的目标水生生物类群及其环境DNA 采样介质

　　水生生物类群

　　鱼类

　　大型底栖无脊椎动物

　　浮游动物

　　重点保护水生生物

　　常用采样介质

　　水体

　　表层沉积物

　　水体

　　根据栖息环境确定

　　适用水体类型

　　河流、湖库

　　河流、浅水湖泊

　　湖泊

　　有重点保护水生生物分布的水体

　　5. 1. 2 采样点位、频次和时间

　　5. 1. 2. 1 总体要求

　　根据水文和污染等情况，避开死水区、回水区和排污口处，选取代表性点位取样，并记录采样点位的

　　环境状况。在河口感潮河段，宜在退潮期采样，并记录采样时的潮汐状况。结合水体流速对eDNA 的影

　　响，高流速区可适当增加采样点间距。

　　5. 1. 2. 2 采样点位的布设

　　可参考生态环境部公布的长江水生态考核水体(见附录A)或长江水生生物监测点位(见附录B)，也

　　可根据需要自行确定。确定采样点时应酌情考虑水体的不同功能区(如饮用水源、污染排放区等)，是否

　　需要根据生物群落的分布特征优化点位布设。

　　5. 1. 2. 3 采样垂线的设置

　　按照HJ 91. 2 执行，具体为：水面宽度≤50 m 时，采样垂线数设为1 条(中泓线);50 m< 水面宽度

　　≤100 m 时，采样垂线数设为2 条(左、右岸有明显水流处);水面宽度>100 m 时，采样垂线数设为3 条

　　(左、中、右)。湖库采样不设断面，对于无明显功能区别的湖库，可用网格法均匀设置采样垂线，否则按水

　　体类别针对不同水域分别设置采样垂线。

　　5. 1. 2. 4 采样垂线上采样点的设置

　　按照HJ 91. 2 执行，具体为：水深≤5 m 时，设置1 个采样点(水面下0. 5 m，水深不足1 m 时，在1/2 水

　　深处);5 m<水深≤10 m 时，设置2 个采样点(水面下0. 5 m，水底上0. 5 m);水深>10 m 时，设置3 个采

　　样点(水面下0. 5 m，中层1/2 水深处，水底上0. 5 m)。

　　5. 1. 2. 5 采样频次

　　根据监测目的和条件选择季度或月度监测。重点关注区域、突发环境问题或其他条件下，可开展更

　　高频次的监测。

　　5. 1. 2. 6 采样时间

　　可按水期、季节或实际研究需要等确定。

　　5. 1. 3 采样方法

　　5. 1. 3. 1 水样

　　5. 1. 3. 1. 1 采集方法。样品采集时，使用清洗干净的玻璃或不锈钢采水器，在不同水体深度采集样品，

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　　同时对采样现场环境进行拍照记录。

　　5. 1. 3. 1. 2 样品过滤。样品应现场过滤，或冷藏保存(-20 ℃或-80 ℃)并于采样后24 h 内过滤收集环

　　境DNA。每个采样点的样品过滤前应对抽滤装置清洁消毒(如，用大于1. 5% 次氯酸钠消毒液浸泡抽滤

　　装置10 min 以上并洗净，再用无水乙醇去除抽滤装置的消毒液残留。水样过滤前，应使用洁净200 μm 筛

　　娟去除水体中中大型浮游动物及大颗粒泥沙杂质，避免后生动物对水体中型以下浮游生物eDNA 的影

　　响。对于比较干净的水体，宜将一份水样过滤于同一张PES 滤膜(一般孔径为0. 22 μm/0. 45 μm);对于

　　浑浊水样可换多张滤膜过滤，针对每一份水样，不论滤膜多少，最终DNA 洗脱液的总体积相同。每个样

　　品抽滤前，应采用相同体积的无菌水代替样品进行过滤获得滤膜，作为空白对照。

　　5. 1. 3. 1. 3 水样过滤体积。一般情况下，长江水体中环境DNA 的水样过滤体积宜为5 L 以上。

　　5. 1. 3. 1. 4 浑浊样品的处理。对于明显浑浊的水样，应放置于4 ℃静置30 min 后取上层澄清水样过滤。

　　5. 1. 3. 1. 5 滤膜样品的保存。过滤完成后，将滤膜样品转移至无菌离心管或冻存管中，置于液氮或干冰

　　中冷冻运输，或者置于保存溶液(无水乙醇或其他合适的保存剂)中4 ℃避光运输。需要长期保存的滤膜

　　样品置于-80 ℃保存。

　　5. 1. 3. 2 沉积物样品

　　使用抓泥斗、D 型网和链式挖泥器等其他便利工具，采集表层沉积物(0 cm~5 cm)50 g(湿重)以上，

　　剔除杂物及明显的生物残体后，收集至无菌离心管中，现场干冰保存。需要长期保存的样品置于-80 ℃

　　保存。

　　5. 2 环境DNA 提取

　　5. 2. 1 样品预处理

　　5. 2. 1. 1 滤膜样品

　　对于在保存剂中保存的滤膜样品，在DNA 提取之前需进行预处理。根据选择的DNA 提取方法，必

　　要时以抽滤等方式先将保存剂(如无水乙醇)清洗干净，然后将滤膜剪碎，再利用研磨珠和裂解液将滤膜

　　振荡破碎。

　　5. 2. 1. 2 沉积物样品

　　将样品均质后冷冻保存。

　　5. 2. 2 DNA 提取

　　根据采样介质不同，可选择适宜的DNA 提取试剂盒，按照试剂盒的使用说明书提取环境DNA。常

　　见的DNA 提取方法包括苯酚氯仿抽提法、离心柱法或磁珠法等，可参见常规分子生物学实验方法或按照

　　GB/T 40226。

　　5. 2. 3 DNA 质量检测

　　DNA 提取后，应对其浓度和质量进行检测。一般用于后续扩增实验的样本DNA 浓度应不低于

　　1 ng/μL，最佳浓度范围为5 ng/μL 以上。DNA 样品在230 nm、260 nm 和280 nm 处的吸光度比值应符合以

　　下要求：OD260/OD280应在1. 7~2. 0 之间，OD260/OD230应大于2. 0。低质量DNA 可以通过纯化提高质量。

　　5. 2. 4 DNA 样品保存

　　提取后的环境DNA 样品分装保存于-80 ℃，避免反复冻融。

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　　5. 3 条形码基因扩增

　　5. 3. 1 扩增引物的确定

　　针对不同的水生生物类群或重点保护水生生物，选择特异性的一对或多对引物对目标类群的条形码

　　基因进行扩增。推荐引物可参照T/CSES 81—2023 或相关文献报道。对于旗舰物种中华鲟和长江江

　　豚，可参照附录C 的特异性引物及扩增方式进行扩增，其他旗舰物种条形码基因的扩增可参考相关文献。

　　5. 3. 2 索引的添加

　　针对大批量样品的扩增，可在引物序列前添加索引(一般6 bp~8 bp)以区分样品。

　　5. 3. 3 基因扩增

　　5. 3. 3. 1 PCR 反应体系

　　总体积一般为25 μL，一般包括扩增缓冲液、dNTPs、引物、Taq DNA 聚合酶和模板DNA，各组分浓

　　度和体积参照PCR 反应试剂盒使用说明书，并可根据试验情况进行调整，剩余体积用灭菌超纯水补齐。

　　PCR 试验前应当检测eDNA 质量及浓度，及时调整模板浓度。过高的初始模板浓度可能会抑制PCR

　　反应。

　　5. 3. 3. 2 PCR 反应程序

　　PCR 反应程序的一般步骤为：预变性;94 ℃~98 ℃变性，温度降至50 ℃~65 ℃退火，70 ℃~75 ℃延伸

　　45 s，进行30 个~40 个循环;然后，70 ℃~75 ℃延伸。试验过程中根据具体情况进行调整。

　　5. 3. 3. 3 阴性和阳性对照

　　分别以灭菌超纯水和明确含有较高浓度目的片段的DNA 作为PCR 扩增的阴性和阳性对照。

　　5. 3. 3. 4 扩增产物的检测

　　用1%~2% 的琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物，结果应呈现单一清晰明亮、无拖尾的条带，且扩增产

　　物的分子量应符合预期。对于单一生物的条形码基因扩增产物，可通过测序鉴定扩增产物是否正确。若

　　电泳检测显示样品出现非目的条带，可按照SN/T 4278 的规定对扩增产物进行纯化。用DNA 浓度分光

　　光度计检测扩增产物的浓度，并保存于-20 ℃或以下温度条件。

　　5. 4 高通量测序

　　5. 4. 1 文库构建

　　5. 4. 1. 1 混库

　　对于大批量样品，可将已经在PCR 扩增时添加了索引的同一个引物的PCR 扩增产物进行等比例混

　　库，混库体积应大于200 μL。混库后对样品行琼脂糖凝胶电泳，确定目的条带位置符合预期。

　　5. 4. 1. 2 末端处理

　　选择相关的试剂盒，按照试剂盒使用说明书进行操作，将混库产物中的DNA 末端补平，并在5’段进

　　行磷酸化和3 端添加dA 尾，以产生黏性末端。

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　　5. 4. 1. 3 接头连接

　　使用相关试剂盒，按照试剂盒使用说明书进行操作，给末端处理产物添加接头。连接时一般推荐的

　　接头和末端处理产物的摩尔比在10∶1~200∶1 之间，具体依据试剂盒说明书确定。对接头连接产物进行

　　磁珠纯化，去除多余接头。

　　5. 4. 1. 4 文库扩增

　　根据实际需求可对文库进行扩增，以增加文库浓度，提高文库质量。

　　5. 4. 1. 5 文库质检

　　对文库长度分布和浓度进行检测，评价文库质量。利用电泳检测文库长度，确保长度符合预期。利用

　　Qubit等方法检测文库浓度，Bioanalyzer等检测文库片段分布，一般要求最低浓度应达到1 ng/μL~3 ng/μL。

　　5. 4. 2 高通量测序

　　对于质检合格的文库，按照GB/T 30989 和GB/T 35537 的规定进行高通量测序，每个样本的预期序

　　列数经拼接后应不低于30 000 条，可根据具体情况调整。

　　5. 5 生物信息学分析

　　5. 5. 1 下机数据预处理与数据清洗

　　5. 5. 1. 1 根据样本索引将序列分配于不同样本中。

　　5. 5. 1. 2 合并双端测序的序列，并去除测序接头、样本索引和引物序列。

　　5. 5. 1. 3 基于滑动窗口法修剪去除低质量碱基，窗口内碱基平均质量一般要求>Q20。

　　5. 5. 1. 4 去除序列长度过短(一般<50 bp)的Reads。

　　5. 5. 1. 5 识别并去除嵌合体序列。

　　5. 5. 1. 6 剔除阴性对照中的污染序列。

　　5. 5. 2 构建OTU

　　5. 5. 2. 1 序列去重后，将相似性≥97% 的序列聚类成OTU。

　　5. 5. 2. 2 识别与OTU 内其他序列平均距离最小的序列作为代表性序列，并检测去除代表性序列中可

　　能的嵌合体序列。

　　5. 5. 2. 3 将测序得到的序列比对到每个OTU 的代表性序列，获得每个OTU 在每个样品中的序列数。

　　5. 5. 2. 4 对于非稀有物种的一般性检测，去除低丰度(一般总序列数为1~5)的OTU。

　　5. 5. 3 物种注释与统计

　　5. 5. 3. 1 根据目标基因和扩增区域，选择合适的条形码基因数据库，如SLIVA 数据库(常用于16S/18S

　　rRNA 基因序列比对)、PR2 数据库(常用于18S rRNA 基因序列比对)、BOLD 数据库(常用于COI 基因序

　　列比对)、Mitofish 数据库(常用于12S 基因序列比对)。

　　5. 5. 3. 2 将OTU 序列与数据库中的信息进行比对分析，综合考虑置信度得分(一般≥0. 7)、序列一致

　　性(一般≥97%)、比对覆盖度(一般≥80%)和E 值(一般≤1e-5)等，确定物种注释信息。

　　5. 5. 3. 3 物种注释结果需进行人工校验，综合考虑选用的条形码片段、参考数据库的完整性、物种栖息

　　环境等，结合专家经验谨慎确定，尽可能减少不确定性。

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　　5. 5. 3. 4 每个样本的OTU 统计表由OTU 名称、序列、物种注释信息、序列数和序列相对丰度组成，每

　　个点位检出的OTU 相对丰度为所有生物重复样本的平均值。

　　5. 5. 3. 5 每个样品宜保留序列相对丰度>0. 01% 的分子分类单元，且某个OTU 在某一点位的生物重

　　复样品中检出率不应低于2/3，否则应舍弃。

　　5. 6 质量控制与保证

　　5. 6. 1 质量控制

　　5. 6. 1. 1 在样品采集、DNA 提取、条形码基因扩增和测序阶段应分别设置阴性对照(无菌水)和阳性对

　　照(已知物种组成的样本、特定物种样本或测序对照试剂)。

　　5. 6. 1. 2 每个采样点位应采集不少于3 个重复样本，也可以在试验过程中设置3 个技术重复。

　　5. 6. 1. 3 对于同一批试验数据，生物信息学分析流程及过滤等参数设置应保持一致。

　　5. 6. 1. 4 对于混合群落的宏条形码，注释物种的假阳性率和假阴性率均不应超过10%。

　　5. 6. 1. 5 对于特定物种的条形码，如果出现假阴性，需要重新优化试验流程;如果出现假阳性，除优化试

　　验流程外，如果是针对特定物种，也可通过测序进行鉴别，如果能够区分则可接受。

　　5. 6. 2 质量保证

　　5. 6. 2. 1 所有采样工作遵循标准化采样流程，使用无菌技术采集样品，避免样品间交叉污染。样品保存

　　与运输应符合其环境特需性。

　　5. 6. 2. 2 试验场所应满足分子生物学实验室的各项条件，保证试验室分区。试验前应对实验室环境消

　　毒灭菌，如进行UV 灭菌或DNA 酶去除等，避免污染和交叉污染。

　　5. 6. 2. 3 每个样品应具备其特定编号，原始数据应归档保存，或上传至GBIF、NCBI 等数据库，确保数

　　据的可溯性和可复现性。

　　6 长江水生生物完整性评价

　　6. 1 评价指标

　　采用生物完整性指数(IBI)的方式进行评价，计算各生物类群IBI 指数包括的评价指标，以及适用的

　　水体类型见表2。

　　6. 2 指标赋分方法

　　根据评价指标的不同，分别利用比值法和偏离度法进行赋分，具体见表2。

　　表2 长江水生生物类群完整性评价指标、赋分方法及适用水体类型

　　序号

　　监测对象

　　鱼类

　　大型底栖无脊椎动物

　　浮游动物

　　重点保护水生生物

　　评价指标

　　种类数

　　优势科

　　种类数

　　优势种

　　多样性

　　种类数

　　赋分方法

　　比值法

　　偏离度法

　　比值法

　　偏离度法

　　比值法

　　适用水体类型

　　河流、湖泊、水库

　　河流、浅水湖泊

　　湖泊

　　有重点保护水生生物分布的水体

　　T/CQSES 27—2025

　　6. 3 评价步骤

　　6. 3. 1 建立参照状态

　　从人类活动干扰强度、河湖/库的物理形态结构，以及水环境质量等方面进行评估和筛选，确定未受

　　或少受人类活动干扰的参照点位，具体按照SL/T 793—2020 执行;无法获得参照点位时，可采用最优状

　　态法或历史数据法等确定参照状态，具体按照HJ 1295—2023 执行。

　　6. 3. 2 确定指标参考值

　　指标参考值按照优先度取参照点位的实测平均值，或参照状态计算值，或专家评判的理想状态。对

　　于重点保护水生生物种类数指标，以国家公布的期望值(见附录A)作为参考值。

　　6. 3. 3 指标赋分

　　6. 3. 3. 1 鱼类

　　6. 3. 3. 1. 1 对于鱼类种类数指标，采用比值法赋分。按照公式(1)计算比值：

　　鱼类种类数比值= 鱼类种类监测值/鱼类种类参考值…………………( 1 )

　　获得比值后，再按照表3 中的赋分标准对指标进行赋分。

　　表3 鱼类种类数指标赋分标准

　　赋分

　　比值

　　≤50%

　　(50%，60%]

　　(60%，70%]

　　(70%，80%]

　　(80%，90%]

　　100

　　>90%

　　6. 3. 3. 1. 2 对于鱼类优势科指标，采用偏离度法赋分。按照公式(2)和公式(3)计算偏离度：

　　鱼类优势科种类比例= 鱼类前2位优势科种类数/鱼类总种类数……………( 2 )

　　偏离度=

　　|鱼类优势科种类比例监测值-鱼类优势科种类比例参考值|

　　鱼类优势科种类比例参考值

　　…………( 3 )

　　获得偏离度值后，再按照表4 中的赋分标准对指标进行赋分。

　　表4 鱼类优势科指标赋分标准

　　赋分

　　偏离度

　　≥25%

　　(20%，25%]

　　(15%，20%]

　　(10%，15%]

　　(5%，10%]

　　100

　　[0，5%)

　　6. 3. 3. 1. 3 取鱼类种类数和鱼类优势科种类比例两项指标中得分较低者值作为鱼类完整性指数的

　　得分。

　　6. 3. 3. 2 大型底栖无脊椎动物

　　6. 3. 3. 2. 1 对于大型底栖无脊椎动物种类数指标，采用比值法赋分。按照公式(4)计算比值：

　　大型底栖无脊椎动物种类数比值=

　　大型底栖无脊椎动物种类数监测值

　　大型底栖无脊椎动物种类数参考值

　　………( 4 )

　　获得比值后，再按照表5 中的赋分标准对指标进行赋分。

　　T/CQSES 27—2025

　　表5 大型底栖无脊椎动物种类数指标赋分标准

　　赋分

　　比值

　　≤20%

　　(20%，30%]

　　(30%，40%]

　　(40%，60%]

　　(60%，80%]

　　100

　　>80%

　　6. 3. 3. 2. 2 对于大型底栖无脊椎动物优势种指标，采用偏离度法赋分。按照公式(5)计算物种优势度，

　　判定优势种，然后按照公式(6)和公式(7)计算偏离度：

　　Y =(ni /N )× fi ……………………………( 5 )

　　式中：

　　Y——物种优势度;

　　ni ——物种i 的OTU reads 总数;

　　N——物种的总OTU reads 数;

　　fi ——出现频率。

　　Y 值>0. 02 的物种判定为优势种。

　　底栖动物优势种个体比例=

　　底栖动物优势种OTU reads总数

　　底栖动物总OTU reads数

　　……………( 6 )

　　偏离度=

　　|底栖动物优势种个体比例监测值-底栖动物优势种个体比例参考值|

　　底栖动物优势种个体比例参考值

　　……( 7 )

　　获得偏离度值后，再按照表6 中的赋分标准对指标进行赋分。

　　表6 大型底栖无脊椎动物优势种指标赋分标准

　　赋分

　　偏离度

　　≥24%

　　(20%，24%]

　　(16%，20%]

　　(12%，16%]

　　(8%，12%]

　　100

　　[0，8%)

　　6. 3. 3. 2. 3 取大型底栖无脊椎动物种类数和优势种个体比例两项指标中得分较低者值作为大型底栖无

　　脊椎动物完整性指数的得分。

　　6. 3. 3. 3 浮游动物

　　以香农多样性指数表征浮游动物完整性，采用比值法赋分。按公式(8)计算浮游动物的香农多样性

　　指数，然后按公式(9)计算比值：

　　H = -Σi = 1

　　S ( pi × ln pi ) ……………………………( 8 )

　　式中：

　　pi ——第i 种浮游动物的密度(传统监测)或OTU reads 数量(环境DNA 监测)百分比;

　　S ——评价点位浮游动物的总物种数。

　　浮游动物多样性比值=

　　浮游动物香农多样性指数监测值

　　浮游动物香农多样性指数参考值

　　…………………( 9 )

　　获得比值后，再按照表7 中的赋分标准对指标进行赋分，即为浮游动物完整性指数的得分。

　　表7 浮游动物多样性指标赋分标准

　　赋分

　　比值

　　≤50%

　　(50%，60%]

　　(60%，70%]

　　(70%，80%]

　　(80%，90%]

　　100

　　>90%

　　T/CQSES 27—2025

　　6. 3. 3. 4 重点保护水生生物

　　以重点保护水生生物(国家Ⅰ级和Ⅱ级重点保护水生生物)种类数表征其完整性，采用比值法赋分。

　　按照公式(10)计算比值：

　　重点保护水生生物种类数比值=

　　重点保护水生生物种类数监测值

　　重点保护水生生物种类数参考值

　　…………( 10 )

　　获得比值后，再按照表8 中的赋分标准对指标进行赋分，即为重点保护水生生物完整性指数的得分。

　　表8 重点保护水生生物种类数指标赋分标准

　　赋分

　　比值

　　≤30%

　　(30%，40%]

　　(40%，50%]

　　(50%，60%]

　　(60%，80%]

　　100

　　>80%

　　6. 3. 4 水生生物完整性指数最终得分

　　针对某一评价点位，计算鱼类、大型底栖无脊椎动物、浮游动物和重点保护水生生物完整性指数得分

　　的平均值，作为该点位水生生物完整性指数的最终得分。

　　6. 3. 5 分级评价

　　根据完整性指数最终得分情况，按照表9 中的分级标准对评价点位的水生生物完整性进行分级

　　评价。

　　表9 水生生物完整性评价等级划分

　　等级

　　分值

　　优

　　>80

　　良

　　[80，60)

　　中

　　[60，40)

　　差

　　[40，20)

　　劣

　　≤20

　　T/CQSES 27—2025

　　附录A

　　(资料性)

　　长江水生态考核试点水体名单及重点保护水生生物期望值

　　长江水生态考核试点水体名单及重点保护水生生物期望值见表A. 1。

　　表A. 1 长江水生态考核试点水体名单及重点保护水生生物期望值

　　青海

　　四川

　　西藏

　　云南

　　重庆

　　贵州

　　甘肃

　　湖北

　　湖南

　　江西

　　陕西

　　河流

　　长江干流(青海)

　　长江干流(四川)

　　赤水河(四川)

　　岷江

　　嘉陵江(四川)

　　沱江

　　雅砻江

　　长江干流(西藏)

　　长江干流(云南)

　　赤水河(云南)

　　长江干流(重庆)

　　嘉陵江(重庆)

　　乌江(重庆)

　　赤水河(贵州)

　　乌江(贵州)

　　清水江

　　白龙江

　　嘉陵江(甘肃)

　　长江干流(湖北)

　　汉江(湖北)

　　长江干流(湖南)

　　湘江

　　资江

　　沅江

　　澧水

　　长江干流(江西)

　　赣江

　　汉江(陕西)

　　嘉陵江(陕西)

　　序号省份水体类型水体重点保护水生生物物种数

　　T/CQSES 27—2025

　　河南

　　广西

　　安徽

　　江苏

　　浙江

　　上海

　　云南

　　贵州

　　湖北

　　湖南

　　江西

　　安徽

　　江苏

　　上海

　　重庆

　　湖北

　　河南

　　湖泊

　　水库

　　丹江(河南)

　　湘江西源

　　长江干流(安徽)

　　长江干流(江苏)

　　东苕溪

　　西苕溪

　　长江干流(上海)

　　黄浦江

　　滇池

　　草海

　　洪湖

　　洞庭湖

　　鄱阳湖

　　巢湖

　　太湖

　　淀山湖—元荡(江苏)

　　淀山湖—元荡(上海)

　　三峡水库(重庆)

　　三峡水库(湖北)

　　丹江口水库(湖北)

　　丹江口水库(河南)

　　—

　　河流

　　表A.1 长江水生态考核试点水体名单及重点保护水生生物期望值(续)

　　序号省份水体类型水体重点保护水生生物物种数

　　T/CQSES 27—2025

　　附录B

　　(资料性)

　　长江流域水生生物监测位点清单

　　长江流域水生生物监测位点清单见表B. 1。

　　表B. 1 长江流域水生生物监测位点清单

　　直门达

　　通天河大桥

　　庚卓如瓦

　　洛须镇温托村

　　江达县邓科乡

　　江达县波罗乡

　　金江桥

　　五孙庙

　　金沙江树底桥

　　龙洞

　　新华

　　三块石

　　倒流子

　　黄沙坡

　　洗白

　　岔河渡口

　　洛甸河水文站

　　金沙江岗托桥

　　倮果

　　石门子

　　水磨沟村

　　挂弓山

　　江南镇沙嘴上

　　纳溪大渡口(左岸)

　　手爬岩

　　沙溪口

　　蒙姑

　　贺龙桥

　　拉鲱

　　97.2481

　　95.8266

　　96.9622

　　98.9975

　　97.9811

　　98.6020

　　100.5938

　　100.4039

　　100.4373

　　101.4627

　　99.9583

　　104.4516

　　103.8229

　　104.2553

　　104.8118

　　105.2893

　　105.0408

　　98.5967

　　101.7888

　　104.5955

　　99.0550

　　104.7162

　　105.0390

　　105.2302

　　105.5430

　　105.9031

　　103.0314

　　99.3892

　　101.9251

　　33.0219

　　34.0358

　　33.3438

　　29.7111

　　32.4644

　　31.1879

　　26.1838

　　26.5654

　　27.0058

　　26.5384

　　26.9331

　　28.6317

　　28.4728

　　28.6469

　　27.4996

　　27.7147

　　27.6859

　　31.6178

　　26.6010

　　28.7406

　　29.9381

　　28.7815

　　28.7849

　　28.7488

　　28.8950

　　28.8813

　　26.5719

　　28.1706

　　26.3652

　　河流

　　序号点位名称经度纬度水体类型

　　T/CQSES 27—2025

　　渭门桥

　　镇平乡

　　悦来渡口

　　岷江青衣坝

　　凉姜沟

　　彭山岷江大桥

　　岷江东青交界

　　映秀

　　岳店子下

　　河口渡口

　　月波

　　雅砻江口

　　雅江县城上游

　　呷拉乡雅砻江

　　柏枝沙滩

　　金溪电站

　　上石盘

　　金子

　　烈面

　　元西村

　　伍嘉码头

　　新政电站

　　小渡口

　　麻柳包

　　醒觉溪

　　宏缘

　　拱城铺渡口

　　大磨子

　　李家湾

　　老翁桥

　　银山镇

　　幸福村(河东元坝)

　　脚仙村

　　沱江大桥(底)

　　和尚山

　　江津大桥

　　103.8247

　　103.7367

　　103.7401

　　103.7850

　　104.6233

　　103.8916

　　103.8391

　　103.4779

　　103.8668

　　103.9887

　　104.1599

　　101.7996

　　101.0481

　　99.9788

　　101.8198

　　106.2619

　　105.7408

　　106.2278

　　106.1105

　　105.8373

　　106.2629

　　106.2364

　　106.0883

　　106.0343

　　105.8272

　　104.5339

　　104.6806

　　105.2593

　　104.9747

　　105.0075

　　104.9697

　　104.6532

　　105.0225

　　105.4288

　　106.5287

　　106.2530

　　31.7589

　　32.1636

　　29.7273

　　29.4974

　　28.7799

　　30.2114

　　29.9044

　　31.0456

　　30.3575

　　29.1419

　　29.0423

　　26.6120

　　29.2033

　　31.6115

　　27.1095

　　31.1572

　　32.3890

　　30.2134

　　30.5035

　　32.5368

　　30.9585

　　31.3108

　　30.7336

　　31.4010

　　28.8045

　　30.6033

　　30.0608

　　28.9678

　　29.1044

　　29.2658

　　29.6872

　　29.9614

　　29.4413

　　28.8849

　　29.5076

　　29.2670

　　河流

　　表B.1 长江流域水生生物监测位点清单(续)

　　序号点位名称经度纬度水体类型

　　T/CQSES 27—2025

　　100

　　101

　　寸滩

　　丰收坝

　　沙溪镇

　　北温泉

　　井口(嘉陵江右岸)

　　大溪沟

　　梁沱(左岸)

　　长江涪陵菜场沱

　　麻柳嘴

　　锣鹰

　　江口镇烂泥坨

　　鹿角

　　大关桥

　　六广

　　乌江下五龙

　　大乌江镇

　　乌杨树

　　沿河

　　清池

　　黄歧坳

　　茅台

　　九龙囤

　　鲢鱼溪

　　茶园岔河

　　兴仁桥

　　下司

　　旁海

　　茅坪

　　崔家

　　大冲口

　　大源屋

　　白果村

　　白龙江两河口桥

　　姚渡

　　洛大

　　固水子村

　　106.5914

　　106.4643

　　106.9358

　　106.4351

　　106.4603

　　106.5533

　　106.4565

　　107.4045

　　107.4232

　　107.9491

　　107.8386

　　108.2845

　　106.1795

　　106.4354

　　106.8634

　　107.6904

　　108.2381

　　108.5105

　　105.9517

　　106.2584

　　106.3742

　　105.9767

　　105.7339

　　107.4557

　　107.7766

　　107.7822

　　108.0799

　　109.2569

　　110.6706

　　110.7683

　　111.1669

　　111.2676

　　104.4819

　　105.4158

　　104.0030

　　105.0792

　　29.6180

　　29.3949

　　29.7129

　　29.8368

　　29.6633

　　29.5705

　　29.6012

　　29.7115

　　29.5955

　　29.3867

　　29.2818

　　29.1333

　　26.8673

　　27.0067

　　27.3012

　　27.4009

　　27.9969

　　28.6225

　　27.7390

　　27.7817

　　27.8603

　　28.2917

　　28.6078

　　26.3604

　　26.3247

　　26.4944

　　26.7482

　　26.7476

　　25.5236

　　25.7272

　　26.0130

　　26.2509

　　33.6975

　　32.7865

　　33.9797

　　33.3280

　　河流

　　表B.1 长江流域水生生物监测位点清单(续)

　　序号点位名称经度纬度水体类型

　　T/CQSES 27—2025

　　102

　　103

　　104

　　105

　　106

　　107

　　108

　　109

　　110

　　111

　　112

　　113

　　114

　　115

　　116

　　117

　　118

　　119

　　120

　　121

　　122

　　123

　　124

　　125

　　126

　　127

　　128

　　129

　　130

　　131

　　132

　　133

　　134

　　135

　　136

　　137

　　白水江

　　站儿巷

　　烈金坝

　　老君关

　　黄金峡

　　南柳渡

　　兰滩

　　八庙沟

　　鲁光坪

　　黄牛铺

　　灶火庵

　　凤州

　　淅川史家湾

　　荆紫关丹江河桥

　　寺湾镇丹江河桥

　　沈湾

　　白家湾

　　仙人渡

　　陈家坡

　　罗汉闸

　　皇庄

　　黑流渡

　　转斗

　　余家湖

　　汉南村

　　石到

　　小河

　　石牌港

　　岳口

　　宗关

　　云池(白洋)

　　调关

　　柳口

　　砖瓦厂

　　观音寺

　　荆江口

　　106.1176

　　106.2945

　　106.2589

　　109.0742

　　107.8330

　　107.2239

　　109.7911

　　105.9206

　　106.1427

　　106.8396

　　106.4677

　　106.6267

　　111.2159

　　111.0113

　　111.1224

　　111.6007

　　112.0409

　　111.6943

　　110.9033

　　112.5932

　　112.5611

　　112.9414

　　112.4374

　　112.1765

　　113.4028

　　113.5217

　　113.9462

　　112.5255

　　113.0696

　　114.2160

　　111.4379

　　112.6330

　　112.4321

　　112.0619

　　112.2854

　　113.1264

　　33.6034

　　33.7820

　　33.0438

　　32.7156

　　33.1934

　　33.1118

　　32.8794

　　32.8315

　　33.3117

　　34.1950

　　33.9021

　　33.9567

　　33.0805

　　33.2533

　　33.1605

　　32.4650

　　32.0584

　　32.2259

　　32.8046

　　30.6898

　　31.1851

　　30.5411

　　31.4598

　　31.9142

　　30.4045

　　30.4183

　　30.6805

　　30.9930

　　30.5010

　　30.5772

　　30.4310

　　29.6982

　　29.9714

　　30.2848

　　30.2322

　　29.4664

　　河流

　　表B.1 长江流域水生生物监测位点清单(续)

　　序号点位名称经度纬度水体类型

　　T/CQSES 27—2025

　　138

　　139

　　140

　　141

　　142

　　143

　　144

　　145

　　146

　　147

　　148

　　149

　　150

　　151

　　152

　　153

　　154

　　155

　　156

　　157

　　158

　　159

　　160

　　161

　　162

　　163

　　164

　　165

　　166

　　167

　　168

　　169

　　170

　　171

　　172

　　173

　　南津关

　　白浒山

　　纱帽

　　黄盖湖镇右

　　中官铺

　　风波港(右岸)

　　刘佐(左岸)

　　燕矶

　　桑植打鼓泉渡口

　　永定澄潭(区水厂)

　　张公庙

　　澧水三江口

　　窑坡渡

　　永定潭口

　　沙河口

　　大夫庙

　　港子口

　　归阳镇

　　新塘铺

　　城北水厂

　　鱼石村

　　樟树港

　　熬洲

　　桔子洲

　　昭山

　　马家河

　　诸葛庙

　　五强溪

　　浦市上游

　　陈家河(四水厂)

　　武水汇合口

　　侯家淇

　　萝卜湾

　　坡头

　　城陵矶(右岸)

　　天字一号

　　111.2537

　　114.6287

　　114.0906

　　113.6003

　　115.5045

　　115.1860

　　116.1150

　　115.0122

　　110.1042

　　110.4353

　　111.6497

　　111.2985

　　111.8752

　　110.6358

　　112.0933

　　111.5470

　　111.6426

　　112.1806

　　112.5813

　　112.6101

　　112.7319

　　112.8021

　　112.9325

　　112.9522

　　112.9978

　　113.0337

　　111.6169

　　110.9115

　　110.1115

　　111.6428

　　110.1655

　　110.3786

　　110.0222

　　112.1176

　　113.1722

　　112.9158

　　30.7687

　　30.5484

　　30.3083

　　29.8661

　　29.8443

　　30.2143

　　29.8233

　　30.4067

　　29.4551

　　29.1253

　　29.6008

　　29.5884

　　29.5937

　　29.1897

　　29.2600

　　26.2790

　　26.5032

　　26.5371

　　26.7780

　　26.9122

　　26.9792

　　28.5686

　　27.3281

　　28.1678

　　27.9720

　　27.8489

　　26.2068

　　28.7746

　　28.0852

　　28.9848

　　28.2866

　　28.4107

　　27.1486

　　28.9130

　　29.4833

　　29.6978

　　河流

　　表B.1 长江流域水生生物监测位点清单(续)

　　序号点位名称经度纬度水体类型

　　T/CQSES 27—2025

　　174

　　175

　　176

　　177

　　178

　　179

　　180

　　181

　　182

　　183

　　184

　　185

　　186

　　187

　　188

　　189

　　190

　　191

　　192

　　193

　　194

　　195

　　196

　　197

　　198

　　199

　　200

　　201

　　202

　　203

　　204

　　205

　　206

　　207

　　208

　　209

　　陆城

　　江南镇

　　君山长江取水口

　　桂花渡水厂

　　桃谷山

　　球溪

　　万家嘴

　　新化水厂

　　晒谷滩电站

　　坪口

　　临资口

　　瓦石矶

　　株溪口

　　新庙前

　　青原七姑岭

　　新干车头

　　生米

　　丰城小港口

　　吴城赣江

　　周坊

　　吉里

　　马当渡口

　　湖口(右岸)

　　彭泽红光村

　　九江县大屋何

　　陈家墩(右岸)

　　皖河口(左岸)

　　前江口(左岸)

　　五步沟(右岸)

　　民生水厂(右岸)

　　三兴村(底)

　　元宝圩(左岸)

　　东西梁山

　　乌江(左岸)

　　塘浦

　　荆湾

　　113.2847

　　113.4357

　　112.9747

　　111.4266

　　112.1366

　　111.4460

　　112.3867

　　111.3031

　　111.4106

　　111.0989

　　112.7300

　　112.5285

　　111.3272

　　114.9242

　　115.0392

　　115.3333

　　115.8056

　　115.8650

　　116.0162

　　116.0439

　　116.1283

　　116.6519

　　116.2008

　　116.4028

　　115.6928

　　117.9648

　　116.9954

　　117.2387

　　117.7376

　　117.4523

　　118.4967

　　117.7216

　　118.3568

　　118.4947

　　119.6054

　　119.7782

　　29.6083

　　29.7631

　　29.4825

　　27.2074

　　28.5419

　　27.6024

　　28.6168

　　27.7194

　　27.3300

　　28.0478

　　28.7000

　　28.7139

　　28.3986

　　25.9953

　　26.9731

　　27.6854

　　28.5417

　　28.2619

　　29.1884

　　28.7864

　　28.7783

　　29.9917

　　28.7783

　　29.8592

　　29.8381

　　31.0784

　　30.4892

　　30.5734

　　30.8063

　　30.6789

　　31.7788

　　30.9985

　　31.5014

　　31.8425

　　30.6459

　　30.8288

　　河流

　　表B.1 长江流域水生生物监测位点清单(续)

　　序号点位名称经度纬度水体类型

　　T/CQSES 27—2025

　　210

　　211

　　212

　　213

　　214

　　215

　　216

　　217

　　218

　　219

　　220

　　221

　　222

　　223

　　224

　　225

　　226

　　227

　　228

　　229

　　230

　　231

　　232

　　233

　　234

　　235

　　236

　　237

　　238

　　239

　　240

　　241

　　242

　　243

　　244

　　245

　　铁路桥

　　新港口

　　递铺

　　汪家埠

　　城南翻水站

　　东升

　　城西大桥

　　毗山

　　团结闸

　　高港码头(左岸)

　　小河口上游(左岸)

　　焦山尾(右岸)

　　浏河(右岸)

　　魏村(右岸)

　　九乡河口

　　下青龙港

　　小湾(右岸)

　　启东港

　　朝阳农场

　　崇明东滩(左岸)

　　东风西沙

　　白龙港(右岸)

　　青草沙进水口

　　淀峰

　　夏字圩

　　闵行西界

　　吴淞口

　　临江

　　草海中心

　　灰湾中

　　罗家营

　　观音山东

　　观音山中

　　观音山西

　　海口西

　　滇池南

　　120.0165

　　120.1269

　　119.6884

　　119.8675

　　120.0723

　　120.0678

　　120.0736

　　120.1368

　　121.0486

　　119.8632

　　119.0800

　　119.5614

　　121.3241

　　119.9619

　　118.9495

　　120.4908

　　120.2723

　　121.6081

　　121.8908

　　121.9457

　　121.2768

　　121.7369

　　121.5459

　　120.9792

　　121.1537

　　121.3439

　　121.5035

　　121.4603

　　102.6428

　　102.6903

　　102.7492

　　102.7611

　　102.7094

　　102.6756

　　102.6300

　　102.6364

　　30.8817

　　30.9401

　　30.6529

T/CALC 12-2025 智慧人文视角下的居民健康状况评价指标体系

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